MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015564	TCG	2	6	195777	195782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4002	NC_015564	CGGT	2	8	195797	195804	0 %	25 %	50 %	25 %	333917855
4003	NC_015564	CGA	2	6	195808	195813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4004	NC_015564	ACG	2	6	195980	195985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4005	NC_015564	CCT	2	6	196017	196022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917855
4006	NC_015564	GC	3	6	196029	196034	0 %	0 %	50 %	50 %	333917855
4007	NC_015564	CAGT	2	8	196035	196042	25 %	25 %	25 %	25 %	333917855
4008	NC_015564	TCC	2	6	196112	196117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917855
4009	NC_015564	GCA	2	6	196134	196139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4010	NC_015564	GCG	2	6	196169	196174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917855
4011	NC_015564	GCG	2	6	196181	196186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917855
4012	NC_015564	CAC	2	6	196245	196250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917855
4013	NC_015564	CCG	2	6	196271	196276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917855
4014	NC_015564	TCGC	2	8	196280	196287	0 %	25 %	25 %	50 %	333917855
4015	NC_015564	GAT	2	6	196306	196311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917855
4016	NC_015564	AGG	2	6	196330	196335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917855
4017	NC_015564	TGA	2	6	196404	196409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917855
4018	NC_015564	GCCC	2	8	196430	196437	0 %	0 %	25 %	75 %	333917855
4019	NC_015564	GCT	2	6	196445	196450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4020	NC_015564	CCG	2	6	196511	196516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917855
4021	NC_015564	AGA	2	6	196521	196526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917855
4022	NC_015564	GC	3	6	196610	196615	0 %	0 %	50 %	50 %	333917855
4023	NC_015564	GCCT	2	8	196735	196742	0 %	25 %	25 %	50 %	333917855
4024	NC_015564	CGG	2	6	196743	196748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917855
4025	NC_015564	GTC	2	6	196798	196803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4026	NC_015564	TGAT	2	8	196808	196815	25 %	50 %	25 %	0 %	333917855
4027	NC_015564	GAG	2	6	196867	196872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917855
4028	NC_015564	CGG	2	6	196989	196994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917855
4029	NC_015564	CCGC	2	8	197093	197100	0 %	0 %	25 %	75 %	333917855
4030	NC_015564	CAG	2	6	197107	197112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4031	NC_015564	AGC	2	6	197149	197154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4032	NC_015564	CCA	2	6	197168	197173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917855
4033	NC_015564	TGC	2	6	197205	197210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4034	NC_015564	GGC	2	6	197225	197230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917855
4035	NC_015564	CGT	2	6	197277	197282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4036	NC_015564	GTGG	2	8	197298	197305	0 %	25 %	75 %	0 %	333917855
4037	NC_015564	TGC	2	6	197314	197319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4038	NC_015564	CAG	2	6	197367	197372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917855
4039	NC_015564	GT	3	6	197392	197397	0 %	50 %	50 %	0 %	333917855
4040	NC_015564	CCT	3	9	197442	197450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917856
4041	NC_015564	TCG	2	6	197454	197459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917856
4042	NC_015564	CAT	2	6	197466	197471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917856
4043	NC_015564	TG	3	6	197479	197484	0 %	50 %	50 %	0 %	333917856
4044	NC_015564	ACT	2	6	197508	197513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917856
4045	NC_015564	CA	3	6	197602	197607	50 %	0 %	0 %	50 %	333917857
4046	NC_015564	CGT	2	6	197657	197662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4047	NC_015564	CAGCG	2	10	197732	197741	20 %	0 %	40 %	40 %	333917857
4048	NC_015564	CGC	2	6	197742	197747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917857
4049	NC_015564	TAG	2	6	197756	197761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917857
4050	NC_015564	CGA	2	6	197822	197827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4051	NC_015564	TCG	2	6	197851	197856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4052	NC_015564	AGC	2	6	197878	197883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4053	NC_015564	TCC	2	6	197887	197892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917857
4054	NC_015564	GA	4	8	197896	197903	50 %	0 %	50 %	0 %	333917857
4055	NC_015564	CGC	2	6	197910	197915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917857
4056	NC_015564	ACA	2	6	198046	198051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917857
4057	NC_015564	ACG	2	6	198076	198081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4058	NC_015564	CGAC	2	8	198199	198206	25 %	0 %	25 %	50 %	333917857
4059	NC_015564	TTG	2	6	198223	198228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917857
4060	NC_015564	TCG	2	6	198391	198396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4061	NC_015564	GCT	2	6	198422	198427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917857
4062	NC_015564	CAAC	2	8	198448	198455	50 %	0 %	0 %	50 %	333917857
4063	NC_015564	CCA	2	6	198566	198571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917857
4064	NC_015564	GC	3	6	198678	198683	0 %	0 %	50 %	50 %	333917857
4065	NC_015564	TCAC	2	8	198697	198704	25 %	25 %	0 %	50 %	333917857
4066	NC_015564	AAC	2	6	198854	198859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917858
4067	NC_015564	GC	3	6	198895	198900	0 %	0 %	50 %	50 %	333917858
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4070	NC_015564	GGGGA	2	10	199090	199099	20 %	0 %	80 %	0 %	333917859
4071	NC_015564	CGG	3	9	199145	199153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917859
4072	NC_015564	ACT	2	6	199165	199170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917859
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4074	NC_015564	GAC	2	6	199297	199302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917859
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4078	NC_015564	CGA	2	6	199404	199409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917859
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4088	NC_015564	CGG	2	6	200289	200294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917860
4089	NC_015564	ACG	2	6	200420	200425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917860
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4091	NC_015564	TCG	2	6	200720	200725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917860
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4100	NC_015564	GT	3	6	201111	201116	0 %	50 %	50 %	0 %	333917861
4101	NC_015564	TCGA	2	8	201124	201131	25 %	25 %	25 %	25 %	333917861
4102	NC_015564	GCA	2	6	201161	201166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917861
4103	NC_015564	C	6	6	201239	201244	0 %	0 %	0 %	100 %	333917861
4104	NC_015564	ACC	2	6	201262	201267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917861
4105	NC_015564	GGT	2	6	201296	201301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917861
4106	NC_015564	GTG	2	6	201307	201312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917861
4107	NC_015564	CGG	2	6	201318	201323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917861
4108	NC_015564	AGC	2	6	201445	201450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917861
4109	NC_015564	CACC	2	8	201482	201489	25 %	0 %	0 %	75 %	333917861
4110	NC_015564	CCCA	2	8	201700	201707	25 %	0 %	0 %	75 %	333917862
4111	NC_015564	CG	4	8	201736	201743	0 %	0 %	50 %	50 %	333917862
4112	NC_015564	CAC	2	6	201748	201753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917862
4113	NC_015564	GGA	2	6	201757	201762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917862
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4118	NC_015564	AGGC	2	8	202205	202212	25 %	0 %	50 %	25 %	333917863
4119	NC_015564	CTG	2	6	202272	202277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917863
4120	NC_015564	TTTG	2	8	202393	202400	0 %	75 %	25 %	0 %	333917863
4121	NC_015564	TCC	2	6	202413	202418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917863
4122	NC_015564	CT	3	6	202453	202458	0 %	50 %	0 %	50 %	333917863
4123	NC_015564	TCG	2	6	202491	202496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917863
4124	NC_015564	CGG	2	6	202555	202560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917863
4125	NC_015564	AGTG	2	8	202603	202610	25 %	25 %	50 %	0 %	333917863
4126	NC_015564	CAC	2	6	202620	202625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917864
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4225	NC_015564	GGGAC	2	10	206699	206708	20 %	0 %	60 %	20 %	333917867
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4228	NC_015564	CGTC	2	8	206897	206904	0 %	25 %	25 %	50 %	333917868
4229	NC_015564	GCA	2	6	206917	206922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4230	NC_015564	TCT	2	6	206924	206929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917868
4231	NC_015564	CGT	2	6	207002	207007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4232	NC_015564	GTG	2	6	207021	207026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917868
4233	NC_015564	AGG	2	6	207028	207033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917868
4234	NC_015564	CGA	2	6	207078	207083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917868
4235	NC_015564	GC	3	6	207131	207136	0 %	0 %	50 %	50 %	333917868
4236	NC_015564	TGG	2	6	207170	207175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917868
4237	NC_015564	ACC	2	6	207202	207207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917868
4238	NC_015564	GCGT	2	8	207233	207240	0 %	25 %	50 %	25 %	333917868
4239	NC_015564	TACC	2	8	207287	207294	25 %	25 %	0 %	50 %	333917868
4240	NC_015564	TCCG	2	8	207511	207518	0 %	25 %	25 %	50 %	333917869
4241	NC_015564	AAG	2	6	207535	207540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917869
4242	NC_015564	ATC	2	6	207559	207564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917869
4243	NC_015564	CGT	2	6	207599	207604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917869
4244	NC_015564	TCA	2	6	207611	207616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917869
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4247	NC_015564	CGG	2	6	207753	207758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917869
4248	NC_015564	TGGACG	2	12	207764	207775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333917869
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4270	NC_015564	CGT	2	6	208589	208594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
4271	NC_015564	GCT	2	6	208659	208664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917870
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4274	NC_015564	TAG	2	6	208716	208721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917870
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4483	NC_015564	GGCG	2	8	219624	219631	0 %	0 %	75 %	25 %	333917884
4484	NC_015564	GACC	2	8	219659	219666	25 %	0 %	25 %	50 %	333917884
4485	NC_015564	GTG	2	6	219677	219682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917884
4486	NC_015564	GTCA	2	8	219736	219743	25 %	25 %	25 %	25 %	333917884
4487	NC_015564	CCA	2	6	219768	219773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917884
4488	NC_015564	TGA	2	6	219795	219800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917884
4489	NC_015564	CAT	2	6	219894	219899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917884
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4491	NC_015564	TCG	2	6	219926	219931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917884
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